L'église protestante de Bischwiller a été construite en 1300 par l'évêque de Strasbourg, Frédéric de Lichtenberg, elle était dédiée à Notre-Dame. À court d'argent, l'évêque de Strasbourg vend le fief de Bischwiller à divers seigneurs ou patriciens pour aboutir en 1542 aux ducs de Deux-Ponts qui sont protestants. L'église protestante a été entourée d'une muraille crénelée au XVIe siècle afin de servir de lieu de refuge aux habitants en cas de guerre. Au XVIIIe siècle elle est agrandie, et le Prince de Deux-Ponts y fait aménager une loge ducale. L'orgue de tribune a été réalisé par le facteur d'orgues Andreas Silbermann en 1723, il fut remanié au XXe siècle par la maison Stiehr-Mockers. L'orgue Silberman-Stiehr-Mockers de l'église protestante de Bischwiller a été classé aux Monuments historiques en 1973 pour la partie instrumentale et le buffet inscrit en 1976.